Modelowanie molekularne dla projektowania leków B - laboratorium 1200-1CHMMOBL6
W ramach pracowni studenci będą mogli zapoznać się z programami do modelowania molekularnego i wizualizacji molekuł chemicznych i biologicznych (m.in. Yasara, VMD, PyMol). W części programów będzie możliwość budowania i modyfikacji związków chemicznych i białek. Ćwiczenia pozwolą także na nabycie umiejętności korzystania z internetowych baz danych związków chemicznych i ich celów molekularnych (m.in. PubMed i PDB). Nabycie umiejętności programowania w języku Python pozwoli wykonać m.in. ćwiczenie na zastosowanie metod sztucznej inteligencji (deep learning) do celów klasyfikacji dużych zbiorów danych.
Studenci z grupy B wykonają dodatkowo (w porównaniu do grupy A) trzy ćwiczenia obejmujące m.in. programowanie w języku Python i komendy Linux/shell.
Rodzaj przedmiotu
Tryb prowadzenia
zdalnie
Wymagania (lista przedmiotów)
Założenia (lista przedmiotów)
Założenia (opisowo)
Koordynatorzy przedmiotu
Efekty kształcenia
Po praktycznym wykonaniu wszystkich zaplanowanych ćwiczeń student powinien umieć posługiwać się wybranymi programami do modelowania molekularnego i wizualizacji struktur jak i dynamiki molekularnej, oraz umieć wyszukiwać potrzebne informacje z internetowych baz danych struktur związków chemicznych i biologicznych celów molekularnych. Powinien także umieć posługiwać się językiem programowania Python na poziomie podstawowym wyższym.
Kryteria oceniania
Wymagania związane z uczestnictwem w zajęciach: brak.
Dopuszczalna liczba nieobecności usprawiedliwionych: wymagane jest zaliczenie wszystkich ćwiczeń, także w terminach dodatkowych.
Ocena jest wystawiana za wykonanie ćwiczenia i sporządzenie raportu. Niezaliczenie raportu skutkuje powtórnym wykonaniem ćwiczenia.
Praktyki zawodowe
Nie dotyczy
Literatura
---
Więcej informacji
Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb: