Modelowanie molekularne dla projektowania leków 1200-1CHMMOW6

Metody modelowania molekularnego i wizualizacji stanowią obecnie jedną z podstawowych części składających się na metodykę projektowania leków. Odnosi się to zarówno dla projektowania leków w oparciu o strukturę celu molekularnego (structure-based drug design) jak i bez tej struktury w oparciu tylko o aktywne i nieaktywne związki chemiczne (ligand-based drug design). W ramach wykładu zostaną omówione podstawy modelowania molekularnego (model CPK), definicja pola siłowego i jego zastosowanie w mechanice i dynamice molekularnej. Zostaną także przedstawione programy do wizualizacji molekuł chemicznych i biologicznych, budowania i modyfikacji związków chemicznych i białek, oraz elementy programowania. Ważnym elementem projektowania leków jest także umiejętność korzystania z internetowych baz danych związków chemicznych i celów molekularnych (białka, DNA, RNA) – zostaną omówione rodzaje informacji jakie się tam znajdują i jak z nich korzystać.