Modelowanie molekularne dla projektowania leków 1200-1CHMMOW6
Metody modelowania molekularnego i wizualizacji stanowią obecnie jedną z podstawowych części składających się na metodykę projektowania leków. Odnosi się to zarówno dla projektowania leków w oparciu o strukturę celu molekularnego (structure-based drug design) jak i bez tej struktury w oparciu tylko o aktywne i nieaktywne związki chemiczne (ligand-based drug design). W ramach wykładu zostaną omówione podstawy modelowania molekularnego (model CPK), definicja pola siłowego i jego zastosowanie w mechanice i dynamice molekularnej. Zostaną także przedstawione programy do wizualizacji molekuł chemicznych i biologicznych, budowania i modyfikacji związków chemicznych i białek, oraz elementy programowania. Ważnym elementem projektowania leków jest także umiejętność korzystania z internetowych baz danych związków chemicznych i celów molekularnych (białka, DNA, RNA) – zostaną omówione rodzaje informacji jakie się tam znajdują i jak z nich korzystać.
- Całkowity nakład pracy studenta: 1.5*30 = 45 godzin.
- Udział w zajęciach: 15 godzin
- Przygotowanie się do zajęć i egzaminu: 20 godzin
- Konsultacje z prowadzącym: 10 godzin
Rodzaj przedmiotu
Tryb prowadzenia
zdalnie
Założenia (lista przedmiotów)
Założenia (opisowo)
Koordynatorzy przedmiotu
Efekty kształcenia
Wiedza: absolwent zna i rozumie w zaawansowanym stopniu aspekty budowy i działania leków, podstawy modelowania molekularnego, oraz rozumie interdyscyplinarny charakter projektowania nowych leków.
Umiejętności: absolwent potrafi stosować aparat pojęciowy i modele jakościowe chemii do analizy i interpretacji własności molekuł, oraz ich oddziaływania z biomolekułami. Umie wyszukiwać potrzebne informacje z internetowych baz danych struktur związków chemicznych oraz biomolekuł, a także posługiwać się językiem programowania Python na poziomie podstawowym.
Kompetencje społeczne: absolwent jest gotów do rozumienia i uznania roli wiedzy w formułowaniu opinii, rozwiązywaniu problemów z dziedziny chemii i nauk biomedycznych. Potrafi dokonać krytycznej oceny posiadanej przez siebie wiedzy i umiejętności oraz oceny wiedzy pozyskiwanej z różnych źródeł.
Kryteria oceniania
Maksymalna liczba nieobecności umożliwiająca osiągnięcie efektów uczenia się - 1.
Zaliczenie przedmiotu: egzamin testowy z ok. 50% pytań zamkniętych i 50% pytań otwartych.
Tak samo przy egzaminie poprawkowym.
Wymagane minimum 50% poprawnych odpowiedzi do zaliczenia.
Praktyki zawodowe
Nie dotyczy
Literatura
---
Więcej informacji
Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb: