Modelowanie molekularne dla projektowania leków 1200-1CHMMOW6
Metody modelowania molekularnego i wizualizacji stanowią obecnie jedną z podstawowych części składających się na metodykę projektowania leków. Odnosi się to zarówno dla projektowania leków w oparciu o strukturę celu molekularnego (structure-based drug design) jak i bez tej struktury w oparciu tylko o aktywne i nieaktywne związki chemiczne (ligand-based drug design). W ramach wykładu zostaną omówione podstawy modelowania molekularnego (model CPK), definicja pola siłowego i jego zastosowanie w mechanice i dynamice molekularnej. Zostaną także przedstawione programy do wizualizacji molekuł chemicznych i biologicznych, budowania i modyfikacji związków chemicznych i białek, oraz elementy programowania. Ważnym elementem projektowania leków jest także umiejętność korzystania z internetowych baz danych związków chemicznych i celów molekularnych (białka, DNA, RNA) – zostaną omówione rodzaje informacji jakie się tam znajdują i jak z nich korzystać.
- Całkowity nakład pracy studenta: 1.5*30 = 45 godzin.
- Udział w zajęciach: 15 godzin
- Przygotowanie się do zajęć i egzaminu: 20 godzin
- Konsultacje z prowadzącym: 10 godzin
Rodzaj przedmiotu
Tryb prowadzenia
zdalnie
Założenia (lista przedmiotów)
Założenia (opisowo)
Koordynatorzy przedmiotu
Efekty kształcenia
WIEDZA: student/studentka po zaliczeniu przedmiotu zna i rozumie
K_W17
- w zaawansowanym stopniu aspekty budowy, działania i syntezy leków orazrozumie interdyscyplinarny charakter projektowania nowych leków i systemówdo ich dostarczania. Zna podstawy modelowania molekularnego.
UMIEJĘTNOŚCI: student/studentka po zaliczeniu przedmiotu potrafi
K_U011
- stosować aparat pojęciowy i modele jakościowe chemii kwantowej do analizyi interpretacji własności atomów i molekuł, oraz przebiegu prostych reakcji chemicznych;
w szczególności:
- potrafi stosować aparat pojęciowy i modele jakościowe chemii do analizy i interpretacji własności molekuł, oraz ich oddziaływania z biomolekułami;
- potrafi wyszukiwać potrzebne informacje z internetowych baz danych struktur związków chemicznych oraz biomolekuł, a także posługiwać się językiem programowania Python na poziomie podstawowym.
Kryteria oceniania
Maksymalna liczba nieobecności umożliwiająca osiągnięcie efektów uczenia się - 1.
Zaliczenie przedmiotu: egzamin testowy z ok. 50% pytań zamkniętych i 50% pytań otwartych.
Tak samo przy egzaminie poprawkowym.
Wymagane minimum 50% poprawnych odpowiedzi do zaliczenia.
Praktyki zawodowe
Nie dotyczy
Literatura
---
Więcej informacji
Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb: