Modelowanie molekularne dla projektowania leków A - laboratorium 1200-1CHMMOAL6
W ramach pracowni studenci będą mogli zapoznać się z programami do modelowania molekularnego i wizualizacji molekuł chemicznych i biologicznych (m.in. Yasara, VMD, PyMol). W części programów będzie możliwość budowania i modyfikacji związków chemicznych i białek. Ćwiczenia pozwolą także na nabycie umiejętności korzystania z internetowych baz danych związków chemicznych i ich celów molekularnych (m.in. PubMed i PDB). Nabycie umiejętności programowania w języku Python pozwoli wykonać m.in. ćwiczenie na zastosowanie metod sztucznej inteligencji (deep learning) do celów klasyfikacji dużych zbiorów danych.
- Całkowity nakład pracy studenta: 2*25 = 50 godzin.
- Udział w zajęciach: 30 godzin
- Przygotowanie się do zajęć: 10 godzin
- Konsultacje z prowadzącymi: 10 godzin
Rodzaj przedmiotu
Tryb prowadzenia
zdalnie
Wymagania (lista przedmiotów)
Założenia (lista przedmiotów)
Założenia (opisowo)
Koordynatorzy przedmiotu
Efekty kształcenia
WIEDZA: student/studentka po zaliczeniu przedmiotu zna i rozumie
K_W17
- w zaawansowanym stopniu aspekty budowy, działania i syntezy leków orazrozumie interdyscyplinarny charakter projektowania nowych leków i systemówdo ich dostarczania. Zna podstawy modelowania molekularnego.
UMIEJĘTNOŚCI: student/studentka po zaliczeniu przedmiotu potrafi
K_U011
- stosować aparat pojęciowy i modele jakościowe chemii kwantowej do analizyi interpretacji własności atomów i molekuł, oraz przebiegu prostych reakcji chemicznych;
w szczególności:
- potrafi stosować aparat pojęciowy i modele jakościowe chemii do analizy i interpretacji własności molekuł, oraz ich oddziaływania z biomolekułami;
- potrafi wyszukiwać potrzebne informacje z internetowych baz danych struktur związków chemicznych oraz biomolekuł, a także posługiwać się językiem programowania Python na poziomie podstawowym.
Kryteria oceniania
Dopuszczalna liczba nieobecności usprawiedliwionych: wymagane jest zaliczenie wszystkich ćwiczeń, także w terminach dodatkowych.
Ocena jest wystawiana za wykonanie ćwiczenia i sporządzenie raportu. Niezaliczenie raportu skutkuje powtórnym wykonaniem ćwiczenia.
Raport jest pisany i wysyłany do prowadzącego podczas zajęć.
Praktyki zawodowe
Nie dotyczy
Literatura
---
Więcej informacji
Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb: