Bioinformatyka II 1200-2MON38L
Tematyką zajęć jest sześć wybranych zagadnień - aktualnych i szeroko stosowanych metod bioinformatycznych:
1) Metody analizy skupień: zachłanne, k-średnich, podejścia hierarchiczne
3) Metody uczenia maszynowego, deep learning
2) Ukryte Modele Markowa i profile sekwencyjne
4) Metody przewlekania białek
5) Modelowanie porównawcze
6) Haszowanie geometryczne i pokrewne algorytmy analizy struktur
W trakcie ostatnich, siódmych zajęć słuchacze zaprezentują wybraną publikację naukową wykorzystującą jedną z w/w metod badawczych
Kierunek podstawowy MISMaP
informatyka
biotechnologia
biologia
matematyka
chemia
Rodzaj przedmiotu
Tryb prowadzenia
Założenia (opisowo)
Koordynatorzy przedmiotu
Efekty kształcenia
Student:
- rozumie teoretyczne podstawy prezentowanych metod obliczeniowych
- umie omówić zastosowany w nich algorytm
- umie w praktyce zastosować wybrane narzędzia bioinformatyczne odpowiednio do postawionego problemu.
Kryteria oceniania
Zaprezentowanie wybranej publikacji naukowej z zakresu wykładu, omówienie metod bioinformatycznych zastosowanych w tejże pracy. Student musi być obecny na wszystkich zajęciach.
Praktyki zawodowe
nie dotyczy
Literatura
Publikacje przeglądowe polecane w trakcie wykładu
Więcej informacji
Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb: