Modelowanie komputerowe układu nerwowego 1100-5NI11
1. Wprowadzenie do Matlaba i Simulinka
2. Modele populacyjne - model rytmu alfa Lopesa da Silvy
3. Zapoznanie z pakietem Neuron, konstrukcja prostych modeli za pomocą interfejsów graficznych
4. Podstawy teoretyczne - potencjał spoczynkowy
5. Symulacje potencjału spoczynkowego
6. Podstawy teoretyczne - potencjał czynnościowy
7. Symulacje potencjału czynnościowego
8. Prądy błonowe i ich rola w kształtowaniu wzorców odpalania w neuronach
9. Podstawy teoretyczne - przekaźnictwo synaptyczne
10. Symulacje przekaźnictwa synaptycznego
11. Proste modele pisane w jezyku hoc
12. Jezyk NMDL
13. Wprowadzenie do programowania obiektowego w jezyku hoc
14. Model neuronu IF (integrate and fire)
15. Sieci neuronów IF
16. Sieci neuronów rzeczywistych
Nakład pracy studenta:
75h - udział w wykładzie i ćwiczeniach - 5 ECTS
30h - przygotowanie do wykładów - 1 ECTS
45h - opracowanie projektu - 1.5 ECTS
Razem: 7.5 ECTS
Tryb prowadzenia
Założenia (opisowo)
Koordynatorzy przedmiotu
Efekty kształcenia
Nauczymy się stosować matematyczne i obliczeniowe metody, w celu zrozumienia dynamicznych własności neuronów, sieci neuronalnych i mechanizmów generacji wybranych rytmów EEG.
Kryteria oceniania
Indywidualny projekt na zaliczenie
Obecność nie ma wpływu na ocenę, lecz jest zalecana.
W ramach przedmiotu można zaliczyć Zespołowy Projekt Studencki za 5 ECTS. W tym celu, w 3-5 osobowych zespołach należy przygotować raport opublikowany w Internecie przedstawiający wybrane zagadnienie opracowane w ramach przedmiotu.
Praktyki zawodowe
Nie dotyczy
Literatura
Nicholas T. Carnevale, Michael L. Hines The NEURON Book, Cambridge University Press, 2006 (free pdf)
Peter Dayan and Laurence F. Abbott Theoretical Neuroscience: Computational and Mathematical Modeling of Neural Systems, MIT Press, 2001 (free pdf)
Wulfram Gerstner and Werner M. Kistler, Spiking Neuron Models: Single Neurons, Populations, Plasticity, Cambridge University Press, 2002 (free html)
D. Johnston and S. M. Wu Foundations of Cellular Neurophysiology, MIT Press 1995
Więcej informacji
Więcej informacji o poziomie przedmiotu, roku studiów (i/lub semestrze) w którym się odbywa, o rodzaju i liczbie godzin zajęć - szukaj w planach studiów odpowiednich programów. Ten przedmiot jest związany z programami:
Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb: