Wstęp do bioinformatyki część II 1100-3BP22
Treść kształcenia: Przegląd podstawowych baz danych, algorytmów i narzędzi informatycznych służących do operacji na sekwencjach nukleotydowych i białkowych. Zaawansowane metody porównywania jednej oraz wielu sekwencji z elementami ewolucji molekularnej. Analiza, porównywanie i adnotacja sekwencji genomowych.
Wykład oraz towarzysząca pracownia dają podstawy zastosowań informatyki i nauk obliczeniowych do analizy białek, projektowania leków, analizy obrazowej oraz wstępu do biologii systemów. Ramowy program jest następujący:
1. Struktury biopolimerów. Grafika molekularna – narzędzia
2. Metody symulacji (MM, MC, MD, BD, etc)
3. Zwijanie białek (jako proces)
4. Modelowanie struktur białek
5. Oddziaływania białko-białko i sieci oddziaływań
6. Podstawy projektowania leków.
7. OMIKi i analiza danych eksperymentalnych pochodzących z –omik
8. Literature mining
9. Systems biology (idea)
10. Analiza informacji obrazowej
Koordynatorzy przedmiotu
Efekty kształcenia
Efekty kształcenia, umiejętności i kompetencje: Studenci biegle i ze zrozumieniem posługują się podstawowymi narzędziami bioinformatycznymi dostępnymi w pakietach programów oraz w postaci serwisów internetowych.
Literatura
Bioinformatics and Functional Genomics, Jonathan Pevsner
DNA. Tajemnica życia, J. D. Watson i A. Berry, wyd: CiS oraz W.A.B, Warszawa, 2005 (ISBN 83-7414-007-0)
DNA. The secret of life, J. D. Watson and A. Berry, wyd: A. F. Knopf, New York, 2003 (ISBN 0-375-41546-7)
Więcej informacji
Więcej informacji o poziomie przedmiotu, roku studiów (i/lub semestrze) w którym się odbywa, o rodzaju i liczbie godzin zajęć - szukaj w planach studiów odpowiednich programów. Ten przedmiot jest związany z programami:
Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb: