Master's degree, second cycle programme, Bioinformatics and Systems Biology (S2-BIOINF)

Dziedzina: nauki ścisłe i przyrodnicze

Dyscyplina: informatyka, nauki biologiczne, nauki fizyczne, matematyka

Język wykładowy: polski

Tytuł zawodowy, który uzyskasz po skończeniu studiów: magister

Gdzie i kiedy będziesz mieć zajęcia

Miejsce: Zajęcia odbywają się w Kampusie Ochota, na Wydziale Matematyki, Informatyki i Mechaniki, Wydziale Fizyki, Wydziale Chemii oraz Wydziale Biologii.

Czas: Zajęcia odbywają się od poniedziałku do piątku w godzinach 8:00-20:00.

Jaką wiedzę, umiejętności i kompetencje zdobędziesz na tym kierunku

Nasze studia przygotują Cię do pracy badawczej na styku informatyki, biologii, matematyki i medycyny. Zdobędziesz zaawansowaną wiedzę i umiejętności w zakresie projektowania leków, analizy danych z wysokoprzepustowych technologii eksperymentalnych współczesnej biologii molekularnej, modelowania systemów biologicznych od procesów komórkowych po ewolucję gatunków, wykorzystywania metod uczenia maszynowego do analizy danych biologicznych czy zarządzania projektami bioinformatycznymi. Rozwiniesz kompetencje niezbędne do pracy badawczej: krytyczne myślenie, etyczne podejście do nauki, samodzielność w zdobywaniu wiedzy oraz umiejętność komunikacji naukowej, w tym pracy w interdyscyplinarnym zespole i prezentacji wyników badań.

Po ukończeniu studiów możesz pracować jako

• Specjalista w zakresie metod bioinformatycznych w firmach komercyjnych (biotechnologicznych, farmaceutycznych itd.) oraz instytucjach naukowych zajmujących się naukami biologicznymi, medycznymi czy rolniczymi
• Doktorant, a później naukowiec na uczelniach i w instytucjach badawczych w Polsce i za granicą
• Analityk danych lub data scientist w firmach, instytucjach publicznych i startupach

Czy na kierunku studiów są różne specjalności i specjalizacje

Nie, ale będziesz mógł zindywidualizować swoją ścieżkę studiowania dzięki bardzo elastycznemu programowi studiów i dostępności ponad 500 przedmiotów z zakresu matematyki, informatyki, biologii, fizyki oraz chemii. Podczas rejestracji na studia możesz wskazać seminaria magisterskie, które najbardziej odpowiadają Twoim zainteresowaniom. Do wyboru są następujące interdyscyplinarne seminaria:

• Analiza danych biomedycznych. Seminarium poświęcone jest zastosowaniom biologii obliczeniowej i uczenia maszynowego w analizie danych biomedycznych pochodzących z nowoczesnych technologii, takich jak obrazowanie medyczne, sekwencjonowanie pojedynczych komórek czy profilowanie molekularne. Skupiamy się na modelach probabilistycznych (w tym grafowych), uczeniu maszynowym (także głębokim) i modelach generatywnych, szczególnie w kontekście badań nad nowotworami.
• Bioinformatyka i genomika obliczeniowa. Seminarium poświęcone jest metodom matematycznym i algorytmicznym stosowanym w analizie danych biologicznych, w tym zwłaszcza genomicznych. Podejmowana tematyka obejmuje ewolucję i organizację genomów, genomikę porównawczą oraz analizę sekwencji molekularnych z wykorzystaniem wielkoskalowych technik eksperymentalnych.
• Biomedyczna eksploracja albo statystyczne triki. Tematyka seminarium obejmuje podstawowy dział biologii obliczeniowej jakim jest proteomika, czyli analiza białek w organizmach żywych. Koncentrujemy się na algorytmach i modelach matematycznych pozwalających na interpretację danych pozyskanych technologią spektrometrii.
• Modele matematyczne w biologii i naukach społecznych. Seminarium dotyczy modeli i metod matematycznych w naukach przyrodniczych, medycznych i społecznych. Obejmuje badanie złożonych zjawisk w języku dyskretnych lub ciągłych układów dynamicznych, zarówno deterministycznych, jak i stochastycznych, z wykorzystaniem zarówno podejść analitycznych, jak i modeli obliczeniowych.
• Obliczeniowa genomika regulatorowa. Seminarium poświęcone jest obliczeniowym problemom związanym z procesem regulacji ekspresji genów, w tym przewidywaniu aktywności elementów regulatorowych w genomach, odtwarzaniu sieci regulacji genów, przestrzennej organizacji genomów oraz przewidywaniu struktury i funkcji białek. Wykorzystywane metody obejmują statystyczną analizę danych, uczenie maszynowe, w tym uczenie głębokie, modele probabilistyczne oraz symulacje dynamiki molekularnej.

Czego będziesz się uczyć na studiach

Zajęcia na magisterskim etapie studiów bioinformatycznych można podzielić na cztery grupy:

• Przedmioty obowiązkowe zapewniają wiedzę i umiejętności potrzebne do prowadzenia badań naukowych w najważniejszych obszarach bioinformatyki poprzez zapoznanie z szerokim spektrum zastosowań metod ilościowych do analizy zjawisk biologicznych. Należą do nich między innymi Genomika porównawcza, Modelowanie złożonych systemów biologicznych czy Projektowanie leków.
• Przedmioty kierunkowe pozwalają pogłębić wiedzę i umiejętności w istotnych z punktu widzenia prowadzenia bioinformatycznych badań naukowych obszarach biologii, informatyki, matematyki i fizyki, część z nich ma również charakter interdyscyplinarny. Grupa liczy ok. 20 przedmiotów, wśród których znajdują się między innymi Głębokie sieci neuronowe, Techniki w genomice i transkryptomice, Algorytmy analizy danych genomicznych, Metagenomika i filogenetyka molekularna, Podstawy medycyny molekularnej, Interdyscyplinarny projekt zespołowy.
• Przedmioty obieralne pozwalają pogłębić wiedzę w obszarach biologii, informatyki, matematyki i fizyki, które, choć rzadziej pojawiają się w badaniach bioinformatycznych, mogą wiązać się z tematyką Twojej pracy magisterskiej lub przyszłymi planami zawodowymi. Jest to pula ponad 500 przedmiotów oferowanych na studiach na poziomie magisterskim na kierunkach pokrewnych bioinformatyce.
• Przedmioty uzupełniające umożliwiają uzupełnienie wiedzy niezbędnej do przystąpienia do przedmiotów obowiązkowych i kierunkowych. Jeśli nie posiadasz przygotowania odpowiadającego studiom licencjackim z bioinformatyki, mogą okazać się bardzo pomocne.

Czy podczas studiów będziesz realizować praktyki

Nie.

Czy podczas studiów istnieje możliwość realizacji jednego/kilku semestrów na innej uczelni

Tak, możesz skorzystać z programów MOST lub ERASMUS+.

Gdzie znajdziesz więcej informacji i programie studiów:https://www.mimuw.edu.pl/pl/informator-dla-studentow/