Regulacja transkrypcji u bakterii 1400-235RTR

Mechanizm transkrypcji. Transkrypcyjna organizacja bakteryjnego RNA – operony. Rodzaje RNA, ich funkcje w komórce. Rybosomowy RNA, struktura rybosomów bakteryjnych, podjednostki 50S i 30S. Transportujący RNA, budowa, antykodony. Informacyjny RNA, sekwencje kodujące i niekodujące białek. Transportująco-informacyjny RNA. Polimeraza RNA, budowa i funkcje poszczególnych podjednostek. Podjednostka alfa i jej rola w regulacji transkrypcji. Podjednostka beta, centrum katalityczne enzymu. Podjednostka beta prim, wiązanie matrycy. Podjednostka sigma i jej rola w inicjacji transkrypcji, podstawowa podjednostka sigma, wybrane przykłady alternatywnych podjednostek sigma. Czynniki anty-sigma i anty-anty-sigma, regulacja kaskadowa. Inicjacja transkrypcji, etapy, inicjacja poronna, promotory, sekwencja -35, sekwencja -10, wiązanie się polimerazy RNA z promotorem i jego denaturacja. Kontrola inicjacji, operatory, białka regulacyjne. Kontrola pozytywna i aktywatory, regulon CRP. Kontrola negatywna i represory, operon laktozowy i indukcja, operon tryptofanowy i derepresja, inicjacja transkrypcji bakteriofaga lambda, represor CI, lizogenia. Elongacja transkrypcji i jej regulacja, przerwy transkrypcyjne, białka Gre. Terminacja transkrypcji i jej regulacja. Rho-niezależne terminatory transkrypcji, budowa, funkcja poszczególnych części. Rho-zależne terminatory transkrypcji, białko Rho i inne białka terminacyjne. Antyterminacja transkrypcji i białka antyterminacyjne. Antyterminacja transkrypcji bakteriofaga lambda i rola bakteriofagowych białek N i Q oraz bakteryjnych białek Nus. Atenuacja transkrypcji u bakterii jelitowych, kontrolne znaczenie translacji RNA. Antyterminacja transkrypcji u bakterii gramdodatnich. Potranskrypcyjna modyfikacja RNA. Stabilność RNA. Antybiotyki hamujące transkrypcję, przykłady i mechanizm działania. Globalne systemy regulacji ekspresji genów, regulon cAMP-CRP, struktura CRP, represja kataboliczna, efekt allosteryczny. Regulon sigma 54, aktywatory sigma 54, mechanizmy aktywacji. Regulon szoku cieplnego, odpowiedź szoku cieplnego, autoregulacja, białka szoku cieplnego, transdukcja sygnału. Odpowiedź ścisła, alarmony, różnorodny wpływ alarmonów na ekspresję genów, Regulacja przez RNA, sRNA, ryboregulacja. Sterowanie ekspresją genów na etapie transkrypcji, wektory ekspresyjne.