Molecular methods in ecology and evolution -W 1400-235MMEE-W
Celem kursu jest przedstawienie studentom narzędzi niezbędnych do
projektowania i przeprowadzenia badań molekularnych w ekologii i
biologii ewolucyjnej, z naciskiem na zdolność tworzenia własnych
rozwiązań dla gatunków niemodelowych. W czasie kursu omówiony
zostanie szeroki wachlarz technik, od starszych w rodzaju
mikrosatelitów po najnowsze wykorzystujące zaawansowane
techniki NGS.
Tematy zajęć: Markery genetyczne. Mutacje, dryf, równowaga
Hardego-Weinberga. Teoria naturalna i poszukiwanie śladów
doboru. Struktura populacji, migracje. Filogeografia. Genetyka
konserwatorska, introgresja, hybrydyzacja. Genomika ewolucyjna,
architektura genomu. Zdolności adaptacyjne.
Tryb prowadzenia
Wymagania (lista przedmiotów)
Koordynatorzy przedmiotu
Przedmiot dedykowany programowi
Efekty kształcenia
Wiedza
K_W07 Rozumie wzajemne pokrewieństwa organizmów niemodelowych. Zna zaawansowaną metodologię filogenetyczną pozwalającą na ustalenie relacji pokrewieństwa między organizmami
K_W08 Dostrzega konieczność stosowania zaawansowanych metod statystycznych do analizy danych w ekologii molekularnej
K_W09 Zna specjalistyczne narzędzia bioinformatyczne, konieczne dla rozwiązywania problemów analizy danych molekularnych w ekologii i ochronie środowiska
K_W10 Zna różnorodne techniki i narzędzia badawcze stosowane w badaniach molekularnych gatunków niemodelowych i właściwie planuje ich wykorzystanie do rozwiązywania postawionych zadań
K_W13 Zna zasady planowania badań i wykonywania eksperymentów z zastosowaniem specjalistycznych metod molekularnych stosowanych w ekologii
Umiejętności
K-U01 Wybiera i stosuje techniki i narzędzia badawcze adekwatne do problemów ekologii molekularnej
K_U05 Stosuje adekwatne metody statystyczne oraz algorytmy i techniki informatyczne do opisu zjawisk i analizy danych w ekologii molekularnej
K_U07 Potrafi pod nadzorem opiekuna naukowego planować i wykonać eksperyment z zastosowaniem poznanych metod; umie zaproponować metody przeprowadzenia wskazanych oznaczeń oraz ocenić przydatność metod i ich ograniczenia dla badanego materiału
K_U08 Potrafi krytycznie opracować wybrany problem z zakresu ekologii molekularnej na podstawie danych literaturowych i wyników własnych badań, formułując własne opinie i wnioski
Kompentencje społeczne
K_K03 Potrafi przekazać społeczeństwu wiedzę o najnowszych osiągnięciach nauk przyrodniczych i wyjaśnić zasadność prowadzenia podstawowych badań naukowych w zakresie ekologii molekularnej
K_K06 Stosuje zasady etyki badawczej, rozstrzygając dylematy związane z wykonywaniem zawodu.
K_K07 Odczuwa potrzebę stałego dokształcania się i aktualizowania wiedzy, korzystając ze źródeł naukowych i popularnonaukowych, dotyczących ekologii molekularnej
Kryteria oceniania
egzamin
Literatura
DL Hartl, AG Clark. 2009. Podstawy genetyki populacyjnej. Wydawnictwo UW.
JR Freeland. 2008. Ekologia molekularna. PWN
JC Avise. 2008 Markery molekularne historia naturalna i ewolucja. PWN
AJ Bakre. 2000. Molecular methods in ecology. Blackwell Science Ltd
R Frankham, JD Ballou, DA Briscoe (2003) Introduction to conservation genetics. Cambridge University Press
Więcej informacji
Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb: