Molecular methods in ecology and evolution 1400-235MMEE
Celem kursu jest przedstawienie studentom narzędzi niezbędnych do
projektowania i przeprowadzenia badań molekularnych w ekologii i
biologii ewolucyjnej, z naciskiem na zdolność tworzenia własnych
rozwiązań dla gatunków niemodelowych. W czasie kursu omówiony
zostanie szeroki wachlarz technik, od starszych w rodzaju
mikrosatelitów po najnowsze wykorzystujące zaawansowane
techniki NGS. Na ćwiczeniach studenci uczą się zastosowania teorii
do analizy prawdziwych danych badawczych z wykorzystaniem
darmowego oprogramowania.
Tematy zajęć: Markery genetyczne. Mutacje, dryf, równowaga
Hardego-Weinberga. Teoria naturalna i poszukiwanie śladów
doboru. Struktura populacji, migracje. Filogeografia. Genetyka
konserwatorska, introgresja, hybrydyzacja. Genomika ewolucyjna,
architektura genomu. Zdolności adaptacyjne.
Tryb prowadzenia
Wymagania (lista przedmiotów)
Koordynatorzy przedmiotu
Efekty kształcenia
Wiedza
K_W07 Rozumie wzajemne pokrewieństwa organizmów niemodelowych. Zna zaawansowaną metodologię filogenetyczną pozwalającą na ustalenie relacji pokrewieństwa między organizmami
K_W08 Dostrzega konieczność stosowania zaawansowanych metod statystycznych do analizy danych w ekologii molekularnej
K_W09 Zna specjalistyczne narzędzia bioinformatyczne, konieczne dla rozwiązywania problemów analizy danych molekularnych w ekologii i ochronie środowiska
K_W10 Zna różnorodne techniki i narzędzia badawcze stosowane w badaniach molekularnych gatunków niemodelowych i właściwie planuje ich wykorzystanie do rozwiązywania postawionych zadań
K_W13 Zna zasady planowania badań i wykonywania eksperymentów z zastosowaniem specjalistycznych metod molekularnych stosowanych w ekologii
Umiejętności
K-U01 Wybiera i stosuje techniki i narzędzia badawcze adekwatne do problemów ekologii molekularnej
K_U05 Stosuje adekwatne metody statystyczne oraz algorytmy i techniki informatyczne do opisu zjawisk i analizy danych w ekologii molekularnej
K_U07 Potrafi pod nadzorem opiekuna naukowego planować i wykonać eksperyment z zastosowaniem poznanych metod; umie zaproponować metody przeprowadzenia wskazanych oznaczeń oraz ocenić przydatność metod i ich ograniczenia dla badanego materiału
K_U08 Potrafi krytycznie opracować wybrany problem z zakresu ekologii molekularnej na podstawie danych literaturowych i wyników własnych badań, formułując własne opinie i wnioski
Kompentencje społeczne
K_K03 Potrafi przekazać społeczeństwu wiedzę o najnowszych osiągnięciach nauk przyrodniczych i wyjaśnić zasadność prowadzenia podstawowych badań naukowych w zakresie ekologii molekularnej
K_K06 Stosuje zasady etyki badawczej, rozstrzygając dylematy związane z wykonywaniem zawodu.
K_K07 Odczuwa potrzebę stałego dokształcania się i aktualizowania wiedzy, korzystając ze źródeł naukowych i popularnonaukowych, dotyczących ekologii molekularnej
Efekty kształcenia dla programu studiów obowiązującego od roku akademickiego 2018/2019:
Absolwent zna zasady planowania badań oraz procesów wykorzystujących ekosystemy, biocenozy i inne systemy ekologiczne, w oparciu o osiągnięcia biologii molekularnej.
Absolwent zna i rozumie zasady funkcjonowania technik molekularnych wykorzystywanych w ekologii i badaniach procesów ewolucji.
Absolwent stosuje i upowszechnia zasadę interpretowania zjawisk i procesów przyrodniczych w oparciu o dane empiryczne uzyskane metodami molekularnymi.
Absolwent potrafi formułować i rozwiązywać problemy naukowe poprzez przeprowadzenie eksperymentów, właściwy dobór źródeł i zaawansowanych metod badawczych wykorzystujących techniki molekularne.
Absolwent potrafi kierować pracą swoją oraz zespołu naukowego prowadzącego badania z zakresu ekologii molekularnej i ewolucjonizmu.
Absolwent jest gotowy do krytycznej oceny treści naukowych i popularnonaukowych w zakresie ekologii molekularnej i ewolucyjnej.
Kryteria oceniania
ćwiczenia: praca zaliczeniowa; wykład: egzamin
Literatura
AD Cutter. A primer of molecular population genetics. Oxford University Press 2019
DL Hartl, AG Clark Principles of population genetics. Oxford University Press 2006
Beebee T, Rowe G. An introduction to molecular ecology. Oxford University Press 2004
AJ Bakre. Molecular methods in ecology. Blackwell Science Ltd 2000.
R Frankham, JD Ballou, DA Briscoe. Introduction to conservation genetics. Cambridge University Press 2003
Uwagi
W cyklu 2024L:
ZAWIESZONE W ROKU AKADEMICKIM 2024/25 |
Więcej informacji
Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb: