Cytometria - zastosowania w badaniach biologicznych 1400-228CM
1. Wprowadzenie do cytometrii - jak to działa.
2. Charakterystyka przeciwciał znakowanych fluorochromami i białek fluorescencyjnych .
3. Charakterystyka cytometrów przepływowych i analizatorów obrazu.
4. Przygotowanie próbek do analizy cytometrycznej.
5. Analiza ekspresji markerów powierzchniowych i wewnątrzkomórkowych.
6. Analiza przebiegu cyklu komórkowego, apoptozy i i nekrozy.
7. Inne zastosowanie cytometrii przepływowej w badaniach biologicznych.
8. Kliniczne zastosowanie cytometrii przepływowej.
9. Zastosowanie analizatorów obrazu.
10. Sortowanie komórek.
11. Przegląd metod przetwarzania danych i zaawansowanych analiz multiplexowych
12. prezentacja danych.
Rodzaj przedmiotu
Tryb prowadzenia
Założenia (opisowo)
Koordynatorzy przedmiotu
Efekty kształcenia
wiedza
1. Zna podstawy teoretyczne funkcjonowania cytometru i przygotowania próbek do analiz. (K_W12)
2. Zna podstawowe różnice pomiędzy róznymi typami cytometrów i sorterów w zakresie ich obsługi i oprogramowania. (K_W10)
3. Posiada szeroką wiedzę z zastosowania cytometrii przepływowej do fenotypowych i funkcjonalnych analiz komórek ukladu odpornościowego. (K_W13)
4. Posiada wiedzę w różnych zastosowania cytometrii przepływowej do analizy komórek prokariotycznych i eukariotycznych. (K_W10)
umiejętności
1. Umiejętność korzystania z cytometrów FACSCalibur i Verso, sortera FACSAria, oraz aparatu Pathway. (K_U01)
2. Umiejętność przygotowywania komórek do badań z zastosowaniem cytometrii przepływowej . (K_U01)
3. Umiejętność korzystania z oprogramowania CellQuest, Diva i FACSuite. (K_U01)
4. Jest w stanie planować eksperymenty, na podstawie uzyskanych danych wyciągnąć odpowiednie wnioski oraz interpretować wyniki badań pod kontrolą przełożonego. (K_U07)
umiejętności społeczne
1. Jest przygotowany do zapewnienia warunków bezpieczeństwa w trakcie prowadzonych eksperymentów i jest w stanie ocenić stopień zagrożenia wynikającego z technik eksperymentalnych. (K_K08)
2. Jest odpowiedzialny za badania, które prowadzi zarówno sam jak i we współpracy z innymi. (K_K04)
Efekty kształcenia dla programu studiów obowiązującego od roku akademickiego 2018/2019:
Zna podstawy teoretyczne funkcjonowania cytometru i przygotowania próbek do analiz.
Zna podstawowe różnice pomiędzy róznymi typami cytometrów i sorterów w zakresie ich obsługi i oprogramowania.
Posiada szeroką wiedzę z zastosowania cytometrii przepływowej do fenotypowych i funkcjonalnych analiz komórek ukladu odpornościowego.
Posiada wiedzę w różnych zastosowania cytometrii przepływowej do analizy komórek prokariotycznych i eukariotycznych.
Umiejętność korzystania z cytometrów FACSCalibur i Verso, sortera FACSAria, oraz aparatu Pathway.
Umiejętność przygotowywania komórek do badań z zastosowaniem cytometrii przepływowej.
Umiejętność korzystania z oprogramowania CellQuest, Diva i FACSuite.
Jest w stanie planować eksperymenty, na podstawie uzyskanych danych wyciągnąć odpowiednie wnioski oraz interpretować wyniki badań pod kontrolą przełożonego.
Jest odpowiedzialny za badania, które prowadzi zarówno sam jak i we współpracy z innymi.
Potrafi analizować otrzymane wyniki i dyskutować o nich w oparciu o dostępną literaturę.
Jest gotowy do krytycznej oceny treści naukowych i popularnonaukowych.
Kryteria oceniania
Weryfikacja umiejętności praktycznych w trakcie zajęć. Zliczenie w postaci multimedialnej prezentacji na temat wybranych metod cytometrycznych z ustną weryfikacją wiedzy w trakcie prezentacji.
Praktyki zawodowe
nie są wymagane.
Literatura
1. Practical Flow cytometry H. M. Shapiro, 2003 Wiley-liss
2. Current protocols in cytometry, Wiley
Więcej informacji
Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb: