Techniki mikroskopowe w biologii roślin 1400-225TMBR
W ramach zajęć będą prezentowane następujące zagadnienia:
- przegląd metod utrwalania i barwienia preparatów roślinnych,
- immunodetekcja mikrotubul cytoszkieletu,
- analiza składu ścian komórkowych metodą barwienia metachromatycznego,
- cytochemiczna lokalizacja związków metodą tissue printing,
- detekcja programowanej śmierci komórki (PCD) z zastosowaniem testu kometkowego,
- przyżyciowe obrazowanie chloroplastów w mikroskopie konfokalnym i tworzenie ich trójwymiarowych modeli,
- metody wykorzystania autofluorescencji komórek roślinnych,
- zastosowanie naturalnych barwników roślinnych jako fluorochromów,
Koordynatorzy przedmiotu
Rodzaj przedmiotu
Tryb prowadzenia
Efekty kształcenia
Po opanowaniu materiału STUDENT:
WIEDZA: zna i rozumie
-) w pogłębionym stopniu reguły, a także mechanizmy molekularne (fluorescencja, reakcje immunologiczne, detekcja ROS), komórkowe (organizacja cytoszkieletu, funkcjonowanie organelli, lokalizacja związków) i fizjologiczne (PCD, stres oksydacyjny, procesy wzrostu i różnicowania) analizowane z wykorzystaniem technik mikroskopowych w biologii roślin (K_W05 Bi)
-) specjalistyczne narzędzia bioinformatyczne, konieczne dla rozwiązywania problemów studiowanej specjalności nauk biologicznych w tym metody komputerowej analizy obrazów biologicznych, ilościowej analizy danych mikroskopowych oraz rekonstrukcji obrazów 3D, z wykorzystaniem specjalistycznego oprogramowania (np. ImageJ, AutoQuant) (K_W09 Bi)
-) zaawansowane techniki laboratoryjne, pomiarowe i obrazowe, stosowane w badaniach biologicznych, szczególnie zasady działania, możliwości i ograniczenia zaawansowanych metod mikroskopowych, cytochemicznych i immunologicznych, stosowanych do badania struktury i funkcji komórek roślinnych (K_W12 Bi)
-) zasady planowania badań i wykonywania eksperymentów z zastosowaniem specjalistycznych metod stosowanych w studiowanej specjalności nauk biologicznych, , w szczególności w zakresie projektowania procedur mikroskopowych, doboru metod detekcji (barwienia, immunolokalizacja), przygotowania preparatów oraz analizy uzyskanych danych (K_W13 Bi)
UMIEJĘTNOŚCI: potrafi
-) stosować techniki i narzędzia badawcze adekwatne do problemów studiowanej specjalności nauk biologicznych, w szczególności w zakresie przygotowania preparatów, prowadzenia obserwacji mikroskopowych oraz analizy i interpretacji danych obrazowych (K_U01 Bi)
-) w fachowej literaturze znaleźć prawdopodobne przyczyny niepowodzenia eksperymentów i zmodyfikować odpowiednio przebieg doświadczenia, w szczególności analizując wyniki uzyskane w trakcie ćwiczeń, identyfikując źródła błędów (np. artefakty mikroskopowe, niespecyficzne barwienia) oraz proponując ich rozwiązania (K_U05 Bi)
-) pod nadzorem opiekuna naukowego planować i wykonać eksperyment z zastosowaniem poznanych metod; umie zaproponować metody przeprowadzenia wskazanych oznaczeń oraz ocenić przydatność metod i ich ograniczenia dla badanego materiału, w szczególności dobierając odpowiednią technikę mikroskopową, sposób przygotowania preparatu oraz warunki obserwacji i analizy danych (K_U07 Bi)
-) prezentować krytycznie prace badawcze z zakresu wybranej specjalności nauk biologicznych z użyciem środków komunikacji werbalnej oraz multimediów, w tym z wykorzystaniem technologii informacyjno-komunikacyjnych, w szczególności przedstawiając współczesne zastosowania wybranych technik badawczych na podstawie literatury oraz odnosząc je do własnych wyników eksperymentalnych (K_U09 Bi)
KOMPETENCJE SPOŁECZNE: jest gotów do
-) sprecyzowania priorytetów do określonego zadania z dziedziny nauk biologicznych, w szczególności w planowaniu i realizacji eksperymentów mikroskopowych oraz opracowaniu i prezentacji wyników (K_K05 Bi)
-) stałego dokształcania się i aktualizowania wiedzy, korzystając ze źródeł naukowych i popularnonaukowych, dotyczących specjalistycznych nauk biologicznych, w szczególności w zakresie współczesnych technik mikroskopowych i ich zastosowań (K_K07 Bi)
-) wykazywania odpowiedzialności za ocenę zagrożeń wynikających ze stosowanych technik badawczych oraz do tworzenia ergonomicznych i bezpiecznych warunków pracy, w szczególności podczas pracy z odczynnikami chemicznymi i aparaturą mikroskopową (K_K08 Bi)
-) krytycznej analizy informacji pojawiających się w środkach masowego przekazu i potrafi wykorzystać je w praktyce, w szczególności odnosząc doniesienia dotyczące metod biologicznych do wiedzy naukowej i wyników eksperymentalnych (K_K10 Bi)
Kryteria oceniania
Na łączną ocenę składają się:
-) ocena wyników pracy studenta w czasie ćwiczeń m.in.
jakość uzyskanych preparatów,
-) jakość przygotowanej prezentacji,
zakres i poprawność merytoryczna prezentacji wybranego tematu
-) końcowy egzamin pisemny, pytania otwarte
Udział poszczególnych składowych do uzgodnienia, zazwyczaj 30% : 30% : 40%
Literatura
literatura składa się w większości z publikacji oryginalnych zamieszczonych w różnych czasopismach, tytuły zalecanych artykułów będą podawane przed każdymi ćwiczeniami
pomocny będzie też opracowany na potrzeby ćwiczeń skrypt
Uwagi
|
W cyklu 2025Z:
Zajęcia adresowane dla studentów II stopnia |
W cyklu 2026Z:
Zajęcia adresowane dla studentów II stopnia |