Techniki informatyczne w biologii 1400-112TINFb

Techniki informatyczne w biologii to zajęcia przeznaczone dla osób rozpoczynających
studia, zarówno bez wcześniejszego doświadczenia z narzędziami informatycznymi,
jak i posiadających ogólne umiejętności obsługi komputera, lecz nieznających
specyfiki narzędzi wykorzystywanych w naukach biologicznych. Ich celem jest
przedstawienie praktycznych sposobów wykorzystania komputera w pracy biologa –
od porządkowania danych, poprzez ich analizę, aż po prezentację w formie
czytelnych wykresów.
W ramach zajęć omawiane są:
 sposoby i formaty zapisu danych oraz ich przygotowanie do dalszej pracy,
 źródła wiarygodnych danych naukowych,
 obsługa darmowego środowiska R i programu RStudio – od podstaw po
pierwsze kroki w analizie danych,
 elementy programowania w R: typy danych, zmienne, operatory, instrukcje
warunkowe, pętle oraz tworzenie własnych funkcji,
 wczytywanie i zapisywanie danych w R,
 przygotowywanie i prezentowanie podsumowań oraz zestawień danych
liczbowych

 wizualizacja danych: tworzenie podstawowych wykresów, kategoryzacja
danych na wykresach, prezentacja danych naukowych w formie graficznej.

Treści przekazywane są w sposób przystępny, z unikaniem nadmiernej terminologii
informatycznej, z licznymi przykładami zaczerpniętymi z badań biologicznych.
Uczestnicy nabywają umiejętności, które ułatwiają wykorzystanie narzędzi
informatycznych w dalszym toku studiów oraz w pracy badawczej.

Rodzaj przedmiotu

obowiązkowe
ogólnouniwersyteckie

Tryb prowadzenia

w sali

Założenia (opisowo)

Przedmiot Techniki informatyczne w biologii ma na celu wprowadzenie uczestników w podstawowe narzędzia i techniki informatyczne stosowane w naukach przyrodniczych, w tym w specjalistyczne zasoby internetowe charakterystyczne dla tej dziedziny, a także uzupełnienie umiejętności w zakresie ogólnej obsługi komputera. Zapoznanie się z nimi w zakresie niezbędnym pozwoli, aby na innych przedmiotach, w których są one wykorzystywane, studenci mogli skoncentrować się na treściach merytorycznych, a nie na obsłudze narzędzi.

Koordynatorzy przedmiotu

Robert Meronka
Małgorzata Orłowska

Efekty kształcenia

Absolwent zna i rozumie:
 zastosowanie powszechnie używanych narzędzi analitycznych w biologii jako
środowiska do przetwarzania, opracowywania i matematycznego opisu
danych, a także jako podstawowego narzędzia do analiz statystycznych w
naukach biologicznych, bez znajomości szczegółowych metod analizy (BI:
K_W01, K_W16; BT: K_W03; OP: K_W01),
 możliwości wykorzystania powszechnie stosowanych narzędzi analitycznych
do wizualizacji danych naukowych (BT: K_W08; OP: K_W13).

Absolwent potrafi:
 przetwarzać i opracowywać dane biologiczne, tworzyć podsumowania,
zestawienia i opisy danych (BI: K_U08; BT: K_U05; OP: K_U04),
 posługiwać się najczęściej stosowanymi w biologii narzędziami do
wykonywania analiz matematycznych i statystycznych danych biologicznych,
rozumiejąc sposób ich działania (BI: K_U03, K_U04, K_U08; BT: K_U05; OP:
K_U22),
 przygotować dane do prezentacji i wizualizacji, dobrać odpowiedni rodzaj
prezentacji graficznej oraz opracować je na potrzeby prezentacji pisemnych i
multimedialnych (BI: K_U07; BT: K_U07; OP: K_U21),
 korzystać z elektronicznych źródeł informacji o charakterze biologicznym oraz
dostępnego wolnego oprogramowania (BI: K_U04; BT: K_U03).

Kryteria oceniania

Zaliczenie na ocenę. Na zajęciach dopuszczalne są dwie nieobecności. W trakcie zajęć studenci otrzymują zadania do samodzielnego rozwiązania. Zadania te są oceniane i za rozwiązanie ich są przyznawane punkty. Ocena z przedmiotu wystawiana jest na podstawie sumy zgromadzonych punktów. Szczegółowy regulamin zaliczenia będzie omawiany na pierwszych zajęciach oraz będzie dostępny na stonie kursu na platformie kampus.

Literatura

Nieobowiązkowa, ale zalecana dla powtórek, uzupełnienia i usystematyzowania
wiedzy.
Lander, Jared P.. Język R dla każdego: zaawansowane analizy i grafika statystyczna.
Red. . Warszawa: Promise, 2018, 607 s. ISBN 978-83-7541-398-4

Więcej informacji

Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb:

Strona przedmiotu 1400-112TINFb w USOSweb