Bioinformatyka II 1200-2MON38L
Tematyką zajęć jest sześć wybranych zagadnień - aktualnych i szeroko stosowanych metod bioinformatycznych:
1) Metody analizy skupień: zachłanne, k-średnich, podejścia hierarchiczne
3) Metody uczenia maszynowego, deep learning
2) Ukryte Modele Markowa i profile sekwencyjne
4) Metody przewlekania białek
5) Modelowanie porównawcze
6) Haszowanie geometryczne i pokrewne algorytmy analizy struktur
W trakcie ostatnich, siódmych zajęć słuchacze zaprezentują wybraną publikację naukową wykorzystującą jedną z w/w metod badawczych
Szacowany nakład pracy studenta: 38h, w tym:
- udział w zajęciach: 15h
- konsultacje z prowadzącym: 4h
- przygotowanie do zaliczenia przedmiotu: wyszukanie publikacji odpowiedniej to treści wykładu 2h, jej przeanalizowanie 7h oraz przygotowanie prezentacji 10h
Kierunek podstawowy MISMaP
informatyka
biotechnologia
biologia
matematyka
chemia
Rodzaj przedmiotu
Tryb prowadzenia
Założenia (opisowo)
Koordynatorzy przedmiotu
Efekty kształcenia
Student:
- rozumie teoretyczne podstawy prezentowanych metod obliczeniowych oraz umie omówić zastosowany w nich algorytm (K_W13)
- umie w praktyce zastosować wybrane narzędzia bioinformatyczne odpowiednio do postawionego problemu (K_U02)
- będzie w stanie lepiej dokonać krytycznej oceny treści naukowych i popularnonaukowych (K_K04)
Kryteria oceniania
Zaprezentowanie wybranej publikacji naukowej z zakresu wykładu, omówienie metod bioinformatycznych zastosowanych w tejże pracy. Student musi być obecny na wszystkich zajęciach.
Praktyki zawodowe
nie dotyczy
Literatura
Publikacje przeglądowe polecane w trakcie wykładu
Więcej informacji
Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb: