Elementy bioinformatyki i zarządzania danymi w chemii medycznej 1200-1CHMELBIOL4

Prezentowanie wyników eksperymentalnych w profesjonalny sposób. Struktura, założenia i potrzebne oprogramowanie. Metody autoprezentacji – forma, zasady poprawnego referowania zagadnień naukowych, dostępne narzędzia.
Stosowanie pakietów umożliwiających analizę i wizualizację danych pomiarowych z zakresu chemii, biochemii i biologii oraz przewidywanie wyników eksperymentów (np. Dr_Fit, PeptideCutter, NMR predictor).
Oprogramowanie służące do tworzenia i edycji struktur związków chemicznych, szlaków chemicznych oraz metabolicznych. Wykorzystanie dostępnych narzędzi do tworzenia ilustracji z zakresu chemii i biochemii (szlaki sygnałowe, helisy, β-kartki, enzymy, receptory, etc.). Inkorporacja uzyskanych struktur w tekst naukowy (MarvinSketch, ChemSketch, BioRender) .
Bazy danych związków biologicznie czynnych. Wyszukiwanie struktur 3D białek, kwasów nukleinowych oraz ligandów pozwalające na zrozumienie aspektów biomedycznych, od syntezy protein po szlaki metaboliczne (m. in. Protein Data Bank, MEROPS). Budowanie i wizualizacja modeli molekuł ze szczególnym uwzględnieniem układów o znaczeniu biochemicznym (DNA i RNA o konkretnej sekwencji). Oddziaływania wewnątrz- i międzycząsteczkowe, w tym symulacja wiązań wodorowych (Avogadro, VMD).