Wstęp do mikrobiologii i biologii molekularnej 1100-2BB31
Celem zajęć jest przedstawienie podstawowych wiadomości o mikroorganizmach (bakterie i archeony), metodach ich badania oraz podstawowych technikach biologii molekularnej opartych na bakteriach.
Przedmiot prowadzony jest w formie laboratorium z elementami wstępów teoretycznych do realizowanych zagadnień w formie prezentacji.
PROGRAM:
A: Metody mikrobiologiczne
1. Techniki pracy w laboratorium mikrobiologicznym - praca sterylna, podłoża mikrobiologiczne. Metody posiewu mikroorganizmów na podłoża i inkubacji hodowli. Izolowanie czystych kultur bakterii i określanie ich liczby.
2. Wzrost bakterii w hodowlach płynnych. Cykle życiowe bakterii. Morfologia kolonii bakteryjnej. Selekcja i różnicowanie bakterii na podłożach stałych.
3. Morfologia i budowa komórki bakteryjnej. Barwienie komórek bakteryjnych i obserwacja pod mikroskopem optycznym.
4. Wpływ czynników fizycznych i chemicznych na wzrost bakterii.
B: Genetyka Prokariotów
5. Organizacja genetyczna genomów prokariotycznych. Budowa DNA. Oznaczanie ilościowe DNA – pomiar spektrofotometryczny, spektrofluorymetryczny, oznaczanie jakościowe DNA – elektroforeza DNA.
6. Regulacja ekspresji genów u bakterii. Badanie aktywności operonu laktozowego u E. coli
7. Zmienność prokariotów. Ruchome elementy genetyczne bakterii. Plazmidy. Izolacja DNA plazmidowego metodą lizy alkalicznej.
8. Bakterie a antybiotyki. Klasyfikacja antybiotyków, mechanizm działania, oporność bakterii na antybiotyki.
9. Mechanizmy horyzontalnego transferu genów u bakterii. Transformacja laboratoryjna E. coli
ZAJĘCIA:
Zajęcia obejmują:
• spotkanie organizacyjne,
• 10 spotkań laboratoryjnych – czas trwania spotkania 3 h
• 2 spotkania dodatkowe.
MATERIAŁY:
Przedmiot ma swój Kurs na Platformie e-learningowej Kampus, na którym są zamieszczane wszystkie materiały z zajęć (prezentacje wraz z opisem) oraz materiały uzupełniające i rozszerzające prezentowane zagadnienia.
OBECNOŚĆ:
Obecność na laboratoriach jest obowiązkowa. Możliwe są dwie usprawiedliwione nieobecność. Osoby nieobecne odrabiają zajęcia w terminie dodatkowym.
Tryb prowadzenia
Koordynatorzy przedmiotu
Efekty kształcenia
Po opanowaniu materiału objętego zakresem ćwiczeń student:
WIEDZA
1. zna budowę komórki i funkcjonowanie komórek prokariotycznych, zna różnice w budowie osłon komórkowych u bakterii gramdodatnich i gramujemnych, (K_W06)
2. zna organizację genetyczną genomów prokariotycznych, oraz regulację ekspresji genów u bakterii (K_W06)
3. zna ruchome elementy genetyczne bakterii oraz mechanizmy horyzontalnego transferu genów, (K_W06)
4 . zna podstawowe techniki mikrobiologiczne oraz wybrane metody biologii molekularnej. (K_W04)
UMIEJĘTNOŚCI
1. potrafi pracować sterylnie, uzasadnić wybór sposobu sterylizacji roztworów, pożywek, szkła i drobnego sprzętu, (K_U01)
2. potrafi izolować czyste kultury bakterii, wykonywać posiewy bakterii, przeprowadzać hodowle bakteryjne (K_U01)
3. potrafi przeprowadzać podstawowe barwienia komórek bakteryjnych i dokonać ich obserwacji pod mikroskopem optycznym (K_U01)
3. potrafi izolować DNA plazmidowe metodą lizy alkalicznej i przeprowadzić jego analizę ilościową i jakościową (K_U01)
4. potrafi wykonać transformację laboratoryjną komórek E. coli wektorem plazmidowym (K_U01)
5. potrafi interpretować proste wyniki doświadczeń przeprowadzanych z zastosowaniem bakterii (K_U01, K_U06)
KOMPETENCJE SPOŁECZNE
1. ma świadomość, na czy polega etyka pracy badawczej i odpowiedzialność za rzetelność uzyskiwanych wyników, (K_K04, K_K05)
2. rozumie możliwości wykorzystania bakterii, w biotechnologii, medycynie, ochronie środowiska i w przemyśle. (K_K06, K_K07)
Kryteria oceniania
Zaliczenie zajęć odbywa się na podstawie:
1. kart wyników z dziesięciu ćwiczeń (za każdą kartę można maksymalnie uzyskać 5 punktów - w sumie 50 punktów). Karty są zamieszczane i oddawane w formie zdalnej na kursie przedmiotu na Platformie e-learningowej Kampus.
2. pisemnego końcowego egzaminu w postaci testu wielokrotnego wyboru oraz zadań krótkiej odpowiedzi (z egzaminu można uzyskać maksymalnie 100 punktów)
Do zaliczenia przedmiotu wymagane jest uzyskanie 60 % punktów.
• Nie oddanie karty w wyznaczonym terminie skutkuje otrzymaniem 0 pkt z karty. Nie ma popraw kart.
• Każda osoba ma prawo do jednego terminu egzaminu i jednego terminu egzaminu poprawkowego. W przypadku nieusprawiedliwionej nieobecności na wyznaczonym terminie egzaminu, termin egzaminu przepada.
Praktyki zawodowe
Brak
Literatura
Podstawowe Podręczniki
1. red. J. Baj "Mikrobiologia" PWN 2018
2. Allison Lizabeth A. „Podstawy biologii molekularnej” WUW 2021 i starsze – wybrane zagadnienie
3. Markiewicz Zdzisław, Korsak Dorota, Popowska Magdalena „Antybiotyki w dobie narastającej lekooporności” PWN i PZWL, 2021 – wybrane zagadnienia
Więcej informacji
Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb: