Podstawy chemii z elementami biochemii 1100-1BO09
Program obejmuje cztery powiązane bloki tematyczne, prowadzące od podstaw budowy i oddziaływań chemicznych do chemicznych podstaw działania komórki nerwowej:
1. Chemiczne podstawy budowy i oddziaływań w układach biologicznych.
Budowa atomu w zakresie potrzebnym do rozumienia ładunku, jonów i wiązań chemicznych. Elektroujemność, polarność wiązań i polarność cząsteczek. Wiązania chemiczne: kowalencyjne i jonowe. Oddziaływania niekowalencyjne: elektrostatyczne, wodorowe, van der Waalsa i hydrofobowe.
2.Energia, entalpia, entropia i równowaga w układach biologicznych.
Reakcje i procesy chemiczne jako przemiany układów cząsteczek. Równowaga chemiczna jako stan dynamiczny. Energia procesu i kierunek przemian chemicznych. Entalpia jako pojęcie związane z tworzeniem i zrywaniem oddziaływań. Entropia jako pojęcie związane ze stopniem uporządkowania układu. Zależność między oddziaływaniami, uporządkowaniem cząsteczek i możliwością zajścia procesu. Energia aktywacji jako bariera reakcji.
3.Woda, pH, bufory i jony biologiczne w roztworach wodnych.
Woda jako polarne środowisko procesów biologicznych. Polarność cząsteczki wody i sieć wiązań wodorowych. Rozpuszczanie substancji jonowych i polarnych. Hydratacja jonów. Hydrofilowość, hydrofobowość i efekt hydrofobowy. Związek między wodą, entalpią, entropią i samoorganizacją cząsteczek amfifilowych. Kwasy i zasady w roztworach wodnych. pH i pKa jako pojęcia wyjaśniające ładunek cząsteczek biologicznych. Protonacja i deprotonacja grup funkcyjnych. Bufory biologiczne i ich znaczenie dla stabilności środowiska komórkowego. Jony biologiczne w roztworach wodnych: Na⁺, K⁺, Ca²⁺, Mg²⁺, Cl⁻ i H⁺. Gradienty stężeń i gradienty elektryczne. Jakościowe znaczenie gradientów jonowych dla powstawania potencjału błonowego.
4.Chemiczne podstawy działania komórki nerwowej.
Aminokwasy jako podstawowe jednostki budujące białka. Wiązanie peptydowe. Struktura białek: pierwszorzędowa, drugorzędowa, trzeciorzędowa i czwartorzędowa. Zależność między strukturą białka a jego funkcją. Kataliza enzymatyczna jako obniżanie bariery energetycznej reakcji. ATP jako nośnik energii chemicznej w komórce. Błona biologiczna jako układ wynikający z amfifilowego charakteru lipidów. Selektywna przepuszczalność błony. Białka błonowe: kanały jonowe, pompy, transportery i receptory. Transport przez błony jako konsekwencja różnic stężeń, ładunku cząsteczek i zapotrzebowania komórki na energię. Pompa Na⁺/K⁺-ATPaza jako przykład białka wykorzystującego ATP do utrzymywania nierównomiernego rozmieszczenia jonów. Kanały Na⁺, K⁺, Ca²⁺ i Cl⁻ jako białka umożliwiające selektywny przepływ jonów. Zależność między gradientami jonowymi, otwieraniem kanałów i zmianą stanu elektrycznego błony. Chemiczne podstawy pobudliwości neuronów i transmisji synaptycznej. Rola Ca²⁺ w uwalnianiu neuroprzekaźników. Neuroprzekaźniki i receptory jako przykład rozpoznawania molekularnego. Zakończenie sygnału synaptycznego przez wychwyt zwrotny lub degradację enzymatyczną. Znaczenie metabolizmu energetycznego dla utrzymania gradientów jonowych i pobudliwości komórki nerwowej.
Wykładowca oczekuje od słuchaczy przygotowania w zakresie nauk przyrodniczych na poziomie szkoły średniej.
Wykład zaliczany jest na podstawie egzaminu na ocenę.
Opis przygotowała K.A. Krzyśko wrzesień 2026
Koordynatorzy przedmiotu
W cyklu 2025Z: | W cyklu 2026Z: |
Rodzaj przedmiotu
Efekty uczenia się
Po ukończeniu przedmiotu student:
1. zna podstawowe pojęcia chemii ogólnej, fizykochemii i biochemii niezbędne do rozumienia procesów zachodzących w układach biologicznych;
2. rozumie znaczenie ładunku, polarności, wiązań chemicznych i oddziaływań niekowalencyjnych dla właściwości cząsteczek biologicznych;
3. potrafi wyjaśnić rolę wody, pH, pKa, buforów, hydratacji jonów i efektu hydrofobowego w środowisku komórkowym;
4. rozumie jakościowo znaczenie jonów Na⁺, K⁺, Ca²⁺, Mg²⁺, Cl⁻ i H⁺ oraz gradientów jonowych dla powstawania potencjału błonowego;
5. zna podstawy budowy aminokwasów, białek i błon biologicznych oraz rozumie związek między strukturą białek a ich funkcją;
6. potrafi opisać chemiczne podstawy działania kanałów jonowych, pomp, transporterów i receptorów;
7. rozumie rolę ATP i metabolizmu energetycznego w utrzymaniu gradientów jonowych i pobudliwości komórki nerwowej;
8. potrafi powiązać właściwości chemiczne cząsteczek i jonów z podstawami pobudliwości neuronów oraz transmisji synaptycznej.
•samodzielnego przewidywania możliwych konsekwencji biochemicznych i farmakologicznych istnienia wybranych grup funkcyjnych
•dostrzegania roli i zagrożeń z pojawiania się niektórych związków chemicznych w środowisku naturalnym
Kryteria oceniania
Egzamin pisemny lub ustny w kontakcie osobistym lub zdalnym
Praktyki zawodowe
Nie są przewidywane
Literatura
Literatura:
1. A. Bielański, Podstawy chemii nieorganicznej.
2. W. Kołos, Elementy chemii kwantowej sposobem niematematycznym wyłożone.
3.J.M. Berg, J.L. Tymoczko, G.J. Gatto Jr., L. Stryer, Biochemia, Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa..
4. Materiały przygotowane przez wykładowcę.
Więcej informacji
Więcej informacji o poziomie przedmiotu, roku studiów (i/lub semestrze) w którym się odbywa, o rodzaju i liczbie godzin zajęć - szukaj w planach studiów odpowiednich programów. Ten przedmiot jest związany z programami: