Molecular fundamentals of enzymology 1000-714bMPE
Lecture:
Course content: basics of chemical thermodynamics, the structure of enzymatic proteins, mechanisms of enzymatic catalysis, types of enzymatic reaction kinetics, types of catalytic reactions and enzyme classification, membrane bioenergetics systems.
Classes:
1. Biochemical and enzymatic calculations. Basics of spectrophotometry.
2. Basics of simulation of chemical and enzymatic reactions using computer programs.
3. Basics of enzymatic reaction measurements. Determination of the activity of transaminases in the rabbit blood serum.
4. Measurements of enzymatic kinetics for L-lactate dehydrogenase
5. Mathematical methods for the determination of kinetic parameters of enzymes.
6. Inhibition of enzymatic reactions - simulations in computer programs and data analysis.
7. Mechanisms of enzymatic reactions - simulations in computer programs and data analysis.
8. Application of computer programs to analyze the spatial structure of enzymes.
Course coordinators
Type of course
Learning outcomes
Wiedza:
*Student ma opanowaną wiedzę o budowie i funkcjonowaniu enzymów (K_W04)
*Student ma opanowaną wiedzę na temat podstaw fizykochemicznych katalizy enzymatycznej (K_W01)
Umiejętności:
*Student potrafi stosować podstawowe techniki i narzędzia badawcze w zakresie biologii ze szczególnym uwzględnieniem biochemii, fizyki i biologii molekularnej (K_U02)
*Student potrafi opisywać systemy informatyczne i bioinformatyczne w sposób zrozumiały dla laika (K_U14)
Kompetencje:
*Student jest przygotowany do precyzyjnego formułowania pytań, służących pogłębieniu własnego zrozumienia danego tematu lub odnalezieniu brakujących elementów rozumowania (K_K02)
*Student jest przygotowany do samodzielnego wyszukiwania informacji w literaturze i zasobach internetowych, także w językach obcych (K_K03)
Assessment criteria
Written reports and an exam covering the knowledge of the lectures
Bibliography
J.M Berg, J.L. Tymoczko, L. Stryer. Biochemia, Rozdziały 3,4, 8-10, PWN, Warszawa 2005
S. Strumiło, A. Tylicki. Enzymologia Podstawy, PWN, Warszawa 2020
A. Zgirski, R. Gondko Obliczenia Biochemiczne, PWN, Warszawa 1998
A. Cornish-Bowden. Fundamentals of Enzyme Kinetics, 4th Edition. Elsevier, 2014
https://iubmb.qmul.ac.uk
https://www.gepasi.org
https://copasi.org/