Bioinformatyka 1400-216BINF
1. Wstęp do bioinformatyki. Bazy danych dla Biologii Molekularnej i Biotechnologii - przegląd.
2. Środowisko pakietu GCG. Podstawowe operacje. Przeszukiwanie baz danych przy pomocy słów kluczowych.
3. Porównywanie dwu sekwencji nukleotydowych i aminokwasowych. Przeszukiwanie baz danych sekwencji nukleotydowych i aminokwasowych przy użyciu sekwencji jako zapytań.
4. Porównywanie wielu sekwencji. Analiza rodzin białek, reprezentacja rodziny i przeszukiwanie baz danych przy pomocy profilu sekwencji.
5. Motywy sekwencji związane z funkcją. Motywy rodzin białek, sygnały segregacji do przedziałów komórki, sekwencji kontrolujące ekspresję genów.
6. Zaawansowane operacje programu GCG. Odróżnianie kodujących i niekodujących sekwencji DNA.
7. Ewolucja molekularna. Obsługa pakietu PHYLIP.
8. Sequence Retrieval System - relacyjna baza danych sekwencji.
9. PDB - baza struktur przestrzennych makrocząstek. Grafika molekularna.
10. Modelowanie struktur białek globularnych.
11. Serwery biologiczne w Internecie.
12. Samodzielne rozwiązanie przykładowego, złożonego problemu.
Rodzaj przedmiotu
Koordynatorzy przedmiotu
Więcej informacji
Więcej informacji o poziomie przedmiotu, roku studiów (i/lub semestrze) w którym się odbywa, o rodzaju i liczbie godzin zajęć - szukaj w planach studiów odpowiednich programów. Ten przedmiot jest związany z programami:
- Biotechnologia, niestacjonarne (wieczorowe), pierwszego stopnia
- Biotechnologia, stacjonarne, pierwszego stopnia
Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb: