Biologia molekularna -W 1400-215BM-W
Wykład
Genomy. Sekwencjonowanie genomów - metody i rys historyczny. Mapy genetyczne i fizyczne. Omówienie wybranych genomów - mitochondrialnych, plastydowych, bakteryjnych, eukariotycznych. Interpretacja sekwencji nukleotydowych. Pochodzenie intronów. Polimorfizm sekwencji. Analiza porównawcza genomów. Ewolucja genomów. Poliploidyzacja. Duplikacja. Powstawanie nowych genów. Horyzontalny przepływ genów. Pseudogeny. Sekwencje ruchome, palindromowe, satelitarne, mini- i mikrosatelitarne. Wyspy CpG. Izochory. Eksperymenty genomiczne. Wykorzystanie mikromatryc DNA. Pojęcie operonu. Przykłady różnych mechanizmów regulacji ekspresji genów na poziomie transkrypcji; operon laktozowy, operon arabinozowy, operon tryptofanowy. Regulacja na poziomie potraskrypcyjnym, translacji i potranslacyjnie. Regulacja z udziałem RNA. Pojęcie regulonów, grobalna regulacja funkcjonowania regulonów. "Quorum sensing" -regulacja na poziomie populacji. Replikacja, rekombinacja i naprawa DNA u eukariontów. Chromatyna. Organizacja strukturalna materiału genetycznego eukariontów: histony, nukleosomy; struktury chromatynowe wyższego rzędu. RNA: transkrypcja, obróbka transkryptów. Regulacja transkrypcji u eukariontów: polimerazy RNA, czynniki transkrypcyjne; remodelowanie chromatyny i modyfikacje histonów. Zjawisko interferencji RNA: mikroRNA i RNAi. Metylacja DNA i mechanizmy epigenetyczne. Translacja u eukariontów. Aminokwasy. Właściwości łańcucha polipeptydowego. Struktury drugo-, trzecio- i czwartorzędowe białek. Fałdowanie białek: katalizatory fałdowania, chaperony i chaperoniny. Modyfikacje posttranslacyjne białek.
Rodzaj przedmiotu
Założenia (opisowo)
Efekty kształcenia
WIEDZA:
1. Ma podstawową wiedzę w zakresie biologii molekularnej. Zna i rozumie molekularne podstawy funkcjonowania komórek prokariotycznych i eukariotycznych (K_W01 Bt1).
2. Potrafi wskazać najważniejsze odkrycia naukowe w historii biologii molekularnej (K_W02 Bt1).
3. Wykazuje znajomość podstawowych technik i narzędzi w badaniach zjawisk przyrodniczych w zakresie biologii molekularnej (K_W04 Bt1).
4. Zna podstawy projektowania i wykonywania modyfikacji genetycznych na materiale biologicznym (K_W04 Bt1).
5. Zna podstawy technik informatycznych i wykorzystuje narzędzia informatyczne do pozyskiwania informacji z baz danych (K_W08 Bt1).
UMIEJĘTNOŚCI
1. Wykazuje umiejętność wykorzystania podstawowych baz danych artykułów naukowych oraz sekwencji DNA i białek (K_U03 Bt1).
2. Wykazuje umiejętność poprawnego wnioskowania na podstawie danych eksperymentalnych (K_U06 Bt1).
KOMPETENCJE SPOŁECZNE
1. Wykazuje zdolność do efektywnego wykonywania pracy doświadczalnej w zespole (K_K04 Bt1).
Kryteria oceniania
Forma egzaminu końcowego: pisemna (test pojedynczego wyboru; test wielokrotnego wyboru; pytania opisowe). Warunkiem jego zaliczenia jest uzyskanie 60% możliwych do zdobycia punktów.
Praktyki zawodowe
Nie dotyczy
Literatura
Biologia molekularna bakterii. J. Baj, Z. Markiewicz. Wyd. PWN.
Biochemia. J.M. Berg, J.L. Tymoczko, L. Stryer. Wyd. PWN.
Biologia molekularna. Krótkie wykłady. P.C. Turner, A.G. McLennan, A.D. Bates, M.R.H. White
Genetyka molekularna. P. Węgleński. Wyd. PWN.
Genomy. T.A. Brown
Introduction to Protein Structure. C. Branden, J. Tooze, Garland Publ.
Genes IX. B.Lewin
Brock Biology of Microorganisms. M.T. Madigan, J.M. Martinko
Materiały dostarczone przez zespół prowadzący.
Więcej informacji
Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb: