Obliczeniowa medycyna molekularna 1000-2M14OMM
Program
1.Wstęp do biologii i medycyny molekularnej.
2.Podstawowe biotechnologie: mikromacierze, spektrometria mas, sekwencjonowanie.
3.Mikromacierze hybrydyzacyjne: algorytmy analizy danych.
4.Strukturalne mutacje, a architektura genomu.
5.Choroby mendlowskie.
6.Mikromacierze transkryptomiczne: algorytmy analizy danych.
7.Mikromacierze transkryptomiczne w diagnostyce nowotworów.
8.Spektrometria mas: algorytmy interpretacji widma.
9.Spektrometria mas w diagnostyce medycznej.
10.Modelowanie molekularnych szlaków sygnałowych.
11. Analiza modeli szlaków.
12.Onkogenne szlaki sygnałowe.
Rodzaj przedmiotu
Założenia (lista przedmiotów)
Efekty kształcenia
Wiedza:
1. ma pogłębioną wiedzę z działów matematyki niezbędnych do studiowania bioinformatyki (rachunek prawdopodobieństwa, statystyka, równania różniczkowe) (K_W01)
Umiejętności
1. posiada pogłębioną umiejętność przygotowania wystąpień ustnych, w języku polskim i języku obcym, w zakresie informatyki lub w obszarze leżącym na pograniczu różnych dyscyplin naukowych (K_U11)
2. potrafi przygotować (także w języku angielskim) opracowanie naukowe z wybranej dziedziny informatyki (K_U13)
Kompetencje
1. zna ograniczenia własnej wiedzy i rozumie potrzebę dalszego kształcenia, w tym zdobywania wiedzy poza-dziedzinowej (K_K01)
2. potrafi precyzyjnie formułować pytania, służące pogłębieniu własnego zrozumienia danego tematu (w szczególności w kontaktach z nie-informatykiem) lub odnalezieniu brakujących elementów rozumowania (K_K02)
Kryteria oceniania
Prezentacja i projekt, które trzeba zaliczyć, żeby przystąpić do egzaminu (egzamin ustny).
Literatura
Darren Wilkinson, Stochastic Modelling for Systems Biology, Chapman & Hall, 2011.
K.A. Do, Z.S. Qin, M. Vanucci, Advances in Statistical Bioinformatics Models and Integrative Inference for High-Throughput Data, Cambridge University Press, 2013.
Więcej informacji
Więcej informacji o poziomie przedmiotu, roku studiów (i/lub semestrze) w którym się odbywa, o rodzaju i liczbie godzin zajęć - szukaj w planach studiów odpowiednich programów. Ten przedmiot jest związany z programami:
Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb: